A megmaradt Combine egységek a reaktor felrobbantását tervezik, meg kell hát őket akadályoznunk ebben. Alyx természetesen lezavar minket, hogy ugyan nézzünk már utána a dolgoknak. Nem szép tőle, hisz nekünk mindössze csak egy gravitációs fegyverünk van, de ez is valami. Menjünk le a lifttel, majd odalent iktassuk ki a nekünk rontó Stalkert. Ezután újabb aktiválandó hidakhoz érkezünk. Az első beüzemelése után tudjuk működésre bírni a másikat, majd azon átkelve nyomjuk meg a panelen a piros gombot. Erre a hidak elfordulnak a nekünk megfelelő irányba. Menjünk tovább, másszunk fel a létrán, végezzünk a Combineokkal, majd az itt található gépezetet üzemeljük be egy újabb energiagömbbel. Erre kinyílik egy ajtó, mehetünk tovább. A folyosó végén az oldalt található ajtót tépjük le, majd másszunk be egyenesen az energiagömböket vezető csőbe.  Itt ügyesen oldalazva, kerülgetve a felénk szálló gömböket, másszunk át a cső túlsó végébe, ahol megtaláljuk a kijáratát. Itt jön egy újabb csapat Combine, végezzünk velük, majd indítsuk be a kettes számú berendezést is. Menjünk tovább, majd némi harc után ismét egy energiagömböket szállító csőben kell oldalazgatnunk, mire visszajutunk a fő reaktortérbe. Itt körbe-körbe forgó panelek vannak, ugorjunk az egyikre. Alyxet is látjuk az egyik üveg mögött, az ott található peronra kell kiugranunk, ahogy forog a szerkezet. Ez nem is olyan egyszerű, mert újabb Combine-ok érkeznek, ráadásul egy csapatra való repkedő borotvás is. Először iktassuk ki őket, és csak utána ugorjunk. Itt egy újabb berendezésre bukkanhatunk, amit az istennek sem sikerül működésre bírni. Ez csak úgy lehetséges, ha a normális esetben az energiagömböket tároló sárga oszlopokat megtöltjük gömbökkel. Ha ez megvan, utána már sikerül beüzemelni a hármas számú berendezést is, és a közvetlen robbanásveszély elmúlik. Sőt, visszajutottunk Alyxhez, aki érdekes információ birtokába jutott dr. Judith Moss-ról. Le is másolja a dolgokat, majd elindulunk kifelé. Sajnos energiafegyverünk ismét a régi lesz, már nem tud mindent megfogni. Ez bajos, hiszen rengetegen jönnek már megint, de ne is törődjünk velük. Viszont amikor felénk repül két borotvás, akkor azokat ha megfogjuk az energiafegyverrel és odavisszük Alyxnek, ő át tudja őket programozni úgy, hogy az ellenséget irtsák. Itt végre felszállhatunk egy vonatra, ami talán kivihet minket innen. Nos, a dolgok nem alakulnak oly fényesen. A vonat kisiklik, és egy marékravaló Stalker kerül elő. Mentsük meg tőlük Alyxet, majd hagyjuk el a vonatot, amilyen gyorsan csak lehet.